Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rbp4Q00724 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbp4Q00724 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms