Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Flt3Q00342 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms