Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms