Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PgrQ00175 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PgrQ00175 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms