Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms