Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc1P98083 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms