Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama4P97927 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama4P97927 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama4P97927 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms