Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx2P97474 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms