Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp1P97350 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp1P97350 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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