Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl21bP86792 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl21bP86792 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms