Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprn2P80560 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms