Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx2P80206 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms