Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms