Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms