Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms