Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms