Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms