Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf1P61148 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf1P61148 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf1P61148 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf1P61148 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf1P61148 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms