Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ActbP60710 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ActbP60710 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms