Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms