Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtdsplP58465 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms