Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms