Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms