Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms