Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms