Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms