Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cux1P53564 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux1P53564 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms