Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Map3k1P53349 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k1P53349 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k1P53349 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k1P53349 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k1P53349 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k1P53349 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k1P53349 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k1P53349 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k1P53349 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k1P53349 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k1P53349 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Map3k1P53349 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Map3k1P53349 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Map3k1P53349 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms