Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csrp3P50462 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csrp3P50462 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrp3P50462 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrp3P50462 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrp3P50462 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrp3P50462 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrp3P50462 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms