Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CitP49025 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CitP49025 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CitP49025 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CitP49025 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CitP49025 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms