Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Resp18P47939 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms