Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms