Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syt4P40749 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms