Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tjp1P39447 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tjp1P39447 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms