Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KdrP35918 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KdrP35918 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KdrP35918 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KdrP35918 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KdrP35918 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdrP35918 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KdrP35918 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdrP35918 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdrP35918 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KdrP35918 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdrP35918 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdrP35918 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdrP35918 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KdrP35918 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KdrP35918 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms