Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprkP35822 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprkP35822 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms