Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfc1P35601 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms