Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab20P35295 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms