Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms