Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx2P31316 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms