Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms