Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VtnP29788 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VtnP29788 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VtnP29788 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VtnP29788 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms