Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pabpc1P29341 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms