Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprmP28828 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprmP28828 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprmP28828 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprmP28828 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprmP28828 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms