Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms