Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou2f1P25425 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou2f1P25425 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms