Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk1P22518 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms