Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tap1P21958 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms