Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KitlgP20826 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KitlgP20826 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms