Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim1P20664 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms